因為介質里面包含微量顆粒或者焦炭，在進料的時候連續做高溫滅菌，可能會致使板式冷卻器慢慢堵塞。要是不能馬上進行維修，就會直接導致板式冷卻器的換熱效率受損，還會降低進料流量，導致滅菌質量不盡人意。要是時常做清理，浪費時間，破壞墊片，安裝或者清理辦法不對也會導致橡膠墊滲漏，導致機器使用年限縮短。

更加管用的辦法為：定按照周期采用堿液循環清理。清理辦法就是：制作一定量的pH 12〜13堿性劑，連續清理板式冷卻器循環，慢慢增熱，水溫在80℃〜90℃，時間在10min到20min，需要炮30min分鐘。然后按照實際情況來增加或者縮減浸泡時長，設計流程是標準。這種辦法能夠滿足消毒與清理板式冷卻器的兩種效果
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